KEGG Anotação

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I tem um conjunto de genes (sequências de aminoácidos). Eu quero encontrar as anotações funcionais com base Kegg ou ids KO. Existe alguma base de dados KEGG disponível para download? Eu quero usar explosão com esse banco de dados. Além disso, eu estava olhando para o pacote R que podem me ajudar nesse sentido.

Espero que eu ter esclarecido a minha consulta. Obrigado pela sua resposta com antecedência.

Publicado 19/09/2018 em 12:59
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banco de dados KEGG subscrição exigida:

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

Lista de preços:

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

Se você permanecer interessado aqui é listagem de dados disponíveis:

https://www.kegg.jp/kegg/download/

seqüências FASTA está aqui:

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta

Respondeu 19/09/2018 em 13:30
fonte usuário

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